Mobil sərhəd nəzarəti sistemi sərhədçinin mobilliyini tələb edən şəraitdə (məsələn, dəniz gəmisində, dəmir yolu daşımalarında, hava limanlarında, yük və tranzit reysləri zamanı) istifadə üçün nəzərdə tutulmuşdur. Bu bir portativ cihazdakı sərhəd gözətçisinin mobil iş yeridir. Qurğu dövlət sərhədini keçən səyahətçilərin və nəqliyyat vasitələrinin nəzarəti və qeydiyyatı prosedurlarının keçirilməsi üçün nəzərdə tutulmuşdur. Mobil sərhəd nəzarəti sistemi nəzarət-buraxılış məntəqəsinin heyətinə pasportlardan və şəxsiyyəti təsdiq edən digər sənədlərdən mətn, biometrik və qrafik məlumatları oxumaq və tanımaq imkanı verir.
Mobil BCS proqram və avadanlıq komponentləri uzun müddətli avtonom rejimdə əməliyyat təmin edir və bu cihaz uzaq pasport nəzarətinə ehtiyac olduqda əvəzolunmazdır. Bütün avadanlıq və proqram komponentləri beynəlxalq standartlara tam uyğun hazırlanmışdır.
Adi rejimdə mobil iş stansiyaları onlayn rejimdə işləyir, BCS server komponentləri ilə məlumat mübadiləsi aparır. Əgər sistemin server komponentlərinə qoşulmaq mümkün deyilsə (məsələn, rabitə kanallarının olmaması, sistemin mərkəzi hissəsində nasazlıqların olması istisna halları), sistemin müştəri komponentləri avtonom rejimə keçir. Belə hallarda, iş stansiyaları məlumatları toplayır və daxil edilmiş məlumatların əsas yoxlamalarını yerinə yetirir (məsələn, sənədlərin etibarlılığının yoxlanılması).